陈旧动物皮张DNA如何获取? 最新研究称改良方法
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【摘要】中新网北京5月20日电(记者孙子发)馆内的动物标本通常是干皮标本,存放时间过长的旧皮的DNA含量和质量远低于此新鲜的材料。含有大量来自环境的污染。此外,为了有效保存,很多皮
中新网北京5月20日电(记者孙子发)馆内的动物标本通常是干皮标本,存放时间过长的旧皮的DNA含量和质量远低于此新鲜的材料。含有大量来自环境的污染。此外,为了有效保存,很多皮革样品都经过了特殊的鞣制处理,这也会极大地影响DNA的保存内容和质量。
对于一些珍稀保护动物甚至已经灭绝的动物来说,博物馆里保存的标本可能是唯一可以获取并且可以进行基因研究的生物材料,那么,如何获取这些珍贵的样本DNA信息进行深入的科学研究?
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(中国科学院古生物研究所)分子古生物(古生物)实验室傅巧梅研究团队由云南大学、新疆文化研究所课题组领衔文物考古,大理 近期与德国、越南等多所高校合作完成的“废弃动物皮毛古DNA提取方法比较研究”提供了可行的解决方案。研究表明,改进的古DNA实验室方法在从旧皮中提取DNA方面具有一定优势。该方法在博物馆保存的旧皮肤样本DNA提取中值得推广应用。
这篇论文是对古DNA提取方法比较研究的结果,近期发表在专业学术期刊《动物学研究》上。付乔梅研究员为通讯作者,中国科学院古脊柱研究所张明博士、曹鹏高级工程师、戴清岩工程师为共同第一作者。
张明表示,对旧动物皮肤样本进行基因研究非常罕见。以前没有合适的DNA提取方法可以直接应用。因此,有必要寻找一种适用于陈旧皮肤材料的DNA提取方法。在现有方法的基础上,设计改进的实验并进行比较后,我们可以探索如何利用这些珍贵的动物材料进行全基因组研究。
因此,合作团队在古DNA实验室现有DNA提取方法的基础上,专门对方法进行了改进,并设计了对比实验来确定改进方法的有效性,从而探索一种有效提取古DNA的方法。皮肤样本DNA的实验方法。
本研究比较了四种提取方法对旧皮DNA提取的有效性,比较了所有方法获得的DNA产量和内源短序列数、短序列复杂度、短序列末端损伤、平均短序列的长度。结果发现,虽然四种方法都能有效获取内源DNA片段,但与其他方法相比,改进后的古DNA实验室方法可以获得更多、更优质的DNA信息。改进的古DNA实验室方法在从旧皮肤中获取DNA方面具有一定的优势。同时,研究还发现,影响提取效果的主要原因是第二步纯化。
张明表示,利用这种从旧皮中提取DNA的改进方法,中国科学院古脊研究所古DNA实验室成功获得了6例博物馆收集的灰狼基因组信息和其他稀有和受保护动物 DNA 信息。 (完)
来源:中国新闻网
文章来源:《动物学研究》 网址: http://www.dwxyjzz.cn/zonghexinwen/2021/0707/649.html